PĒTNIEKS
(Sludinājums no NVA)

Nacionālais pētniecības un inovāciju institūts (NIRI), reģ. nr. 40900041720, aicina pieteikties uz vakanto pētnieka amatu (pēcdoktorantūras pētnieks antimikrobiālās rezistences genomikā un mikroorganismu ekoloģijā).

Nacionālais pētniecības un inovāciju institūts (NIRI) aicina pievienoties ambiciozu un sadarbībai atvērtu pēcdoktorantūras pētnieci/pētnieku starpdisciplināram pētniecības projektam, kas veltīts antimikrobiālās rezistences (AMR) izpētei lopkopības sistēmās, balstoties uz “Vienas veselības” pieeju.

Projekts apvieno mikroorganismu ekoloģiju, metagenomiku, pilna genoma sekvenēšanu un vides monitoringu, lai izprastu mehānismus, kas veicina AMR rašanos un izplatību lauksaimniecības un vides ekosistēmās.

Veiksmīgais kandidāts piedalīsies modernākajos genomiskās uzraudzības pētījumos un cieši sadarbosies ar mikrobiologiem, veterinārārstiem, bioinformātiķiem un vides zinātniekiem.

Pienākumi

• Metagenomisko un pilna genoma sekvenēšanas datu analīze
• Baktēriju genomu montāža, anotēšana un salīdzinošā genomika
• Hibrīdo asambleju darbplūsmu īstenošana, izmantojot Illumina un Oxford Nanopore sekvenēšanas datus
• Antimikrobiālās rezistences gēnu, virulences faktoru un mobiloma izpēte
• Genomisko, ekoloģisko un vides datu integrēšana
• Bioinformātikas analīzes darbplūsmu izstrāde un optimizācija metagenomiskajai uzraudzībai
• Doktorantu un jaunāko pētnieku mentoringa nodrošināšana
• Zinātnisko publikāciju, ziņojumu un konferences prezentāciju sagatavošana
• Dalība projektu rezultātu izpildē un sadarbības pētniecības aktivitātēs

Prasības

• Doktora grāds mikroorganismu ekoloģijā, mikrobioloģijā, genomikā, bioinformātikā, skaitļošanas bioloģijā, veterinārajās zinātnēs vai radniecīgās nozarēs
• Padziļināta pieredze metagenomisko un mikrobu genomikas datu analīzē Pieredze darbā Linux/Unix un augstas veiktspējas skaitļošanas (HPC) vidēs
• Programmēšanas vai skriptēšanas prasmes (R, Python, Bash vai līdzīgās valodās)
• Pieredze genoma montāžas un anotēšanas darbplūsmās
• Spēja strādāt patstāvīgi un starpdisciplinārās komandās
• Izcilas zinātniskās komunikācijas un publikāciju sagatavošanas prasmes

Vēlamās prasmes

• Pieredze darbā ar Oxford Nanopore vai PacBio sekvenēšanas tehnoloģijām
• Hibrīdās genoma montāžas rīku pārzināšana
• Metagenoma binings un MAG (metagenomā rekonstruētu genomu) izveide
• AMR datubāzu un genomiskās epidemioloģijas rīku izmantošana
• Darbplūsmu pārvaldības rīku, piemēram, Nextflow vai Snakemake, pārzināšana
• Pieredze vides mikrobioloģijā vai “Vienas veselības“ pieejas pētniecībā
• Plazmīdu un mobiloma analīze

Mēs piedāvājam

• Iespēja veikt augstas ietekmes AMR genomikas pētījumus
• Pieeja modernām sekvenēšanas tehnoloģijām un augstas veiktspējas skaitļošanas (HPC) infrastruktūrai
• Starptautiska, starpdisciplināra un uz sadarbību vērsta pētniecības vide
• Spēcīgs atbalsts publikāciju sagatavošanai un karjeras attīstībai
• Iespējas veidot profesionālos kontaktus un starptautisku sadarbību
• Atalgojums : stundas tarifa likme EUR 22.00
• Pilna darba laika amatu uz noteiktu laiku (uz 2 gadiem)
• Darba vietu Rīgā

Pieteikšanās  noteikumi: Motivācijas vēstule, kurā aprakstītas pretendenta pētnieciskās intereses un motivācija; Curriculum vitae (CV) ar publikāciju sarakstu

NIRI atlases procesā ievēro vienlīdzības principu. Atlases procesā lēmumi tiek pieņemti balstoties tikai uz kvalifikāciju un darba pieredzi.

Sīkāku informāciju par vakanci skatīt NIRI mājas lapā anda.baumane[at]niri.lv.anda.baumane[at]niri.lv ar tematisko norādi: “Postdoc in Metagenomics – EchoHEALTH”.

Darba piedāvājums publicēts:

16.06.2026.8

Pieteikšanās termiņš:

15.07.2026.

Uzņēmums:

Valsts zinātniskais institūts "Nacionālais pētniecības un inovāciju institūts"

Atrašanās vieta:

LATVIJA, Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, Latvija

Darba laiks:

Pilna slodze

Atalgojuma līmenis:

22 – ...

Amata kategorija:

Izglītība / Zinātne